大部分的中藥材都怕潮濕、高溫的環境，放久容易變質減低原有的藥效，所以在保存上就必須特別注意。
正確存放中藥的方式，應是放置乾燥、通風處，避免陽光直射而變質，若有過期、變質或變色的情形應避免服（使）用。
（1）中藥飲片：將藥材放置於陰涼乾燥處，避免陽光照射，或者可放置於密封、不透光的真空罐裡，隔絕空氣進入，而有些藥材因含水量和營養成分高，建議放於冰箱內保存，例如枸杞、紅棗、人蔘、當歸、天門冬…等。
（2）濃縮藥粉：一般只要在室溫下放置於陰涼乾燥處，並避免日光曝曬即可，若需長期服用，建議可存放於防潮箱或冰箱冷藏，避免吸潮結塊而造成藥物變質。
（3）水煎劑：已經煎煮好的藥湯，若沒有喝完，應存放冰箱冷藏，一般不建議隔夜服用，即使放置在冰箱冷藏室中，也不應超過3天，以免藥液變質影響健康。
